Sobre el tema de la geografía a tratar, yo la acotaría de inicio a la época micénica, ya que son esas las ciudades que aparecen en la mayoría de los mitos o por su importancia cronológica, y las de los grandes palacios, amén de que si parecen pocas, las del catálogo de los barcos de Homero podemos usarlas también.
Las leyendas y mitos suelen centrarse en torno a la fundación de ciudades y sus héroes venerados, el ciclo tebano, la guerra de Troya y la Odisea.
Y ya en cuanto a las ciudades, las más importantes en esta época que propongo sería los palacios de Micenas, Tirinto, Pilos, Tebas, Orcómeno, Gla, Iolkos y Cnosos.
Además, también hay fortalezas y asentamientos como Atenas, Argos, Esparta, Corinto, Rodas, Mileto, Eleusis, Calcis, Ilion (Troya), Ceos, Medea, Melos, Egina, Petra, Krisa, Delfos... (Faltan unos cuantos pero son muchos asentamientos, en negrita los más relevantes para mí, por contener restos palaciales o de fortificaciones más allá de un yacimiento, pero se puede completar con alguno más de la lista sugerida, por su importancia en la historia venidera, caso de Esparta, Corinto, Rodas o Mileto, por ejemplo)
Y ya del catálogo de los barcos se suman otras como Phthia, Ítaca, Cefalonia, Tespia, Eutresis, Platea, Epidauro, Mantinea, Tegea... (Completan la segunda lista y algunas de ellas estarían sin duda allí también).
Yo me quedaría con las dos primeras listas, que hay material de sobra, pero si se quiere no cerraría a la tercera el paso del todo (al fin y al cabo, la Ilíada es una historia contada de forma oral, y seguro que algunas de las ciudades citadas en el catálogo de los barcos existían en época micénica, así como seguro que otras no, y serían de no tan antigua fundación).
Para consultar las leyendas fundacionales u otros aspectos de la historia de Grecia antigua yo consulto siempre REA en internet, muy completo y con muchos buenos artículos.